Vantagens e desvantagens
A produção de produtos transgênicos, principalmente para o consumo humano, é alvo de intenso debate entre os defensores da manipulação genética e aqueles que criticam esta prática (como o Greenpeace, por exemplo), acusando-a de ser nociva à saúde.

Vantagens
Podem evitar ou prevenir o risco de pragas e doenças nas plantações;
Aumento da produtividade e rendimentos das colheitas;
Podem ser mais resistentes aos agrotóxicos;
Produção de alimentos enriquecidos com mais proteínas e vitaminas específicas;
Retirar características que podem ser nocivas para as pessoas (por exemplo: retirar a lactose presente no leite, para as pessoas que são alérgicas a este componente).
Desvantagens
Desencadeamento de novos tipos de alergias, devido as diferentes proteínas criadas a partir da manipulação genética;
Podem criar efeitos inesperados no produto, ou seja, os efeitos podem ser imprevisíveis;
Podem ser produzidas substâncias tóxicas, quando há uma perda no controle da manipulação dos transgênicos;
As alterações genéticas podem provocar sérios desequilíbrios ecológicos, afetando a cadeia alimentar de determinado ecossistema;
Diminuição da biodiversidade.